Kvalita vody má významný dopad na akvakulturu. Pro akvakulturu je proto obzvláště důležité znát detekční ukazatele, provádět pravidelné kontroly kvality vody a včas reagovat na úpravu ukazatelů kvality vody.
Mezi hlavní testovací položky pro vody akvakultury patří pH, amoniakální dusík, rozpuštěný kyslík, dusitany, sulfidy a salinita. Mezi nimi jsou základními podmínkami rozpuštěný kyslík a správné pH, zatímco amoniakální dusík, dusitanový dusík a sulfid jsou hlavními toxickými látkami produkovanými metabolismem ryb a krevet. Přesné a včasné měření koncentrace těchto látek a následné přijetí odpovídajících opatření může výrazně zlepšit míru přežití ryb a krevet a snížit náklady na chov.